Andai saja ia tidak memiliki kemampuan untuk mengendalikan pikiran dan tubuh orang lain, Yuu Otosaka pasti hanya seorang siswa SMA biasa. Meskipun efeknya hanya berlangsung selama lima detik setiap kali, kekuatan misterius Yuu memungkinkannya untuk curang demi menjadi yang terbaik di kelasnya dan masuk ke sebuah SMA bergengsi, tempat ia terus melakukan tindakan-tindakan curang.

Tindakan curangnya akhirnya dihentikan oleh Nao Tomori—ketua OSIS yang berkemauan keras dari Akademi Hoshinoumi—yang mampu menembus tipu dayanya. Dengan paksaan, Nao meyakinkan Yuu untuk pindah ke Hoshinoumi dan bergabung dengan dewan siswa. Akademi Hoshinoumi sebenarnya adalah lembaga yang didirikan secara rahasia untuk remaja yang memiliki kemampuan supranatural—dengan dewan siswa berfungsi sebagai sarana untuk melacak mereka yang menyalahgunakan kekuatannya.

Dengan Yuu yang terpaksa membantu urusan dewan, kelompok ini berangkat untuk menemukan dan melindungi pengguna kemampuan baru dari bahaya. Namun, seiring mereka menyelidiki kemampuan-kemampuan tersebut lebih jauh, temuan mereka justru menyeret mereka ke dalam masalah yang jauh lebih rumit daripada yang pernah mereka bayangkan.