Sudah 10 tahun berlalu sejak Heaven's Gate muncul di Amerika Selatan dan Hell's Gate muncul di Jepang, menyelimuti langit malam yang dulu begitu akrab dengan pemandangan langit yang menindas. Dengan tujuan yang tak diketahui, Gerbang-gerbang ini merupakan ruang di mana hukum-hukum fisika pun diabaikan. Seiring kemunculan Gerbang-gerbang tersebut, muncullah para Kontraktor, yang, sebagai ganti kemanusiaan mereka, dianugerahi kemampuan supernatural.

Di kota Jepang yang mengelilingi Hell's Gate, Kepala Seksi 4 Misaki Kirihara menemukan dirinya berselisih dengan seorang Kontraktor terkenal yang memiliki nama sandi Hei. Dikenal sebagai "Black Reaper" di dunia bawah tanah, Hei, seperti rekan-rekannya, menjalankan misi untuk Sindikat yang misterius dan kejam sambil perlahan mengungkap lapisan-lapisan gelap yang menyelimuti sebuah rencana jahat yang mengancam keberadaan para Kontraktor itu sendiri.

Dari imajinasi Tensai Okamura, hadir sebuah thriller fiksi ilmiah yang mengambil bentuk eksposé halus mengenai perang di mana posisi politik dan keadilan tidak memiliki pengaruh—sebuah perang yang dilancarkan secara eksklusif di balik bayang-bayang.