Jauh di masa depan, makhluk hidup yang dikenal sebagai Gadoll tiba-tiba muncul sebagai ancaman bagi umat manusia. Manusia terakhir yang masih hidup di Bumi mengasingkan diri di Tank, sebuah distrik di bagian bawah benteng bergerak raksasa bernama Deca-Dence. Sementara para Gears yang tinggal di lantai atas adalah prajurit yang bertempur sebagai bagian dari Power, sebagian besar penghuni Tank puas memberikan dukungan dari garis belakang, memotong daging Gadoll, dan memperkuat pertahanan. Natsume termasuk di antara mereka yang lebih memilih pergi ke garis depan; tak gentar dengan lengan kanannya yang palsu, ia bertekad bergabung dengan segelintir prajurit Tank yang ikut bertempur bersama para Gears.

Namun, meskipun teman-temannya di panti asuhan masing-masing telah menerima penugasan kerja, pendaftaran Natsume ke Power masih belum disetujui. Sementara itu, ia mulai bekerja sebagai petugas kebersihan di tim perbaikan armor yang dipimpin oleh Kaburagi—seorang pria yang keras kepala dan acuh tak acuh, namun tampaknya menyimpan rahasia lebih dari yang ia tunjukkan. Meskipun awalnya bersikap dingin terhadap bawahannya yang idealis itu, ia segera menyadari potensi yang dimilikinya untuk mengguncang status quo dunia. Sebagai mentor baru Natsume, Kaburagi mempersiapkannya untuk peran khusus dan unik sebagai “bug” yang mengubah permainan dalam sistem.