Takeru Narihira, seorang remaja nakal yang sering bermimpi dikejar-kejar monster, namun selalu diselamatkan oleh seorang gadis misterius. Setelah jatuh cinta padanya, dia berjanji pada pertemuan mereka yang ke 1.999 bahwa dia akan menjadi orang yang akan menyelamatkannya di lain waktu. Namun, sebuah kecelakaan sepeda motor mengirim Takeru ke Denji Heian-kyo-sebuah versi alternatif dari ibu kota kuno Jepang dengan teknologi futuristik dan rumah dari gadis dalam mimpinya, Tsukiyima, yang tidak mengenalinya.

Namun, kabut hitam segera turun ke kota, membekukan penduduk dan melepaskan monster yang disebut oni. Hanya yang disebut onmyouji-penyihir yang menggunakan kekuatan mistis dan mengemudikan pakaian magis "shikigami"-yang dapat melawan mereka. Ketika kabut kembali, Takeru menemukan bahwa dia memiliki kekuatan transformasi yang aneh dan dapat melawan oni. Namun, dia dan Tsukimiya akhirnya terbunuh, dan Takeru terbangun di Denji Heian-kyo sekali lagi, kali ini dua minggu sebelum kemunculan kabut. Bersumpah untuk melindungi Tsukimiya dengan cara apa pun, Takeru bersumpah untuk menjadi onmyouji dan mengubah masa depan.